Не забудьте добавить страницу в закладки, чтобы вернуться к игре
В бой вы отправляетесь всем составом, сразу с четырьмя черепашками-ниндзя в команде: Леонардо, Рафаэлем, Микеланджело и Донателло, и в любой момент можно выбирать любого из них. (На паузе двигайте стрелкой крестика - D-pad)
По сути в игре черепахи ничем не отличаются кроме как цветом повязки и оружием: например палка — посох у Донателло обладает наибольшей дальностью действия и силой, однако скорость перемещения его очень низкая. Вновь ваш путь лежит к Шреддеру и его бандитам, и вновь вам необходимо спасать подругу Эйприл О'Нил из лап этих негодяев. По ходу игры вы будете сражаться с разными врагами — солдатами клана футов и крысоловами, бомбо-метательными дирижаблями и головорезами с цепными пилами. В игре много мини-боссов типа Бибопа, одного из помощников Шреддера. В конце каждого уровня (кроме второго) вы будете сражаться с главным боссом. Как только у вас снизится здоровье, не дайте черепахе погибнуть, а смените её на другую, и потом выберите её снова, чтобы вылечить (взяв пиццу). У вас всего 2 продолжения на всю игру. В игре есть код, позволяющий пропускать уровни. — Смотрите здесь.
В дальнейшем вы сможете найти побежденными и восстановить в команду ваших погибших черепах. Сделать это нельзя только на уровне — реке Гудзон, где игроку приходится плавать под водой и за отведённое время обезвреживать восемь часовых бомб.